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克隆常見問題分析

閱讀次數(shù):1488   發(fā)布時(shí)間:2012/9/26 10:03:21

現(xiàn)象可能原因解決方案 轉(zhuǎn)化后無菌落生長感受態(tài)細(xì)胞已經(jīng)失效用pUC18質(zhì)粒進(jìn)行轉(zhuǎn)化,確認(rèn)細(xì)胞的感受態(tài)效率。1ng pUC18質(zhì)粒至少應(yīng)得到1000個(gè)以上的轉(zhuǎn)化子。如有問題,重新制備感受態(tài)細(xì)胞。平板所用抗性不對pBS-T載體為amp抗性,工作濃度 100 ug/ml 連接中使用了不恰當(dāng)?shù)膙ector:insert 比例估計(jì)PCR產(chǎn)物的量,將vector:insert比例限制在3:1到 1:5的范圍內(nèi)。對于極小的PCR產(chǎn)物進(jìn)行克隆,很可能因?yàn)镻CR產(chǎn)物嚴(yán)重過量,導(dǎo)致無菌落或菌落極少。 白色克隆無插入片段可能反復(fù)凍融導(dǎo)致載體單個(gè)的3’端突出的T已經(jīng)降解試用其他批次的T載體。長期不用的載體請?jiān)?20℃保存,避免反復(fù)凍融載體。做自連對照檢測T載體。如果自連長出大量菌落,請放棄載體。 轉(zhuǎn)化后只有白色克隆本載體加T及連接PCR產(chǎn)物效率非常高,對于一些質(zhì)量很好的PCR產(chǎn)物,有可能轉(zhuǎn)化后菌落全部為白斑平板上未涂 IPTG 或X-Gal如果平板上與空白對照相比,菌落數(shù)明顯增加,則該情況很正常。 絕大部分菌落為藍(lán)色或淡藍(lán)色,只有極少數(shù)的白斑有可能插入片段沒有失活lacZ基因很小的插入片段(<500bp)不一定完全將lacZ基因失活,導(dǎo)致菌斑部分藍(lán)色。如果平板長的菌落很多,而自連對照長的菌落很少,藍(lán)色菌落中就包含有插入片段。挑選一些藍(lán)色菌落提質(zhì)粒進(jìn)行酶切鑒定。正常大小的藍(lán)色或白色菌落周圍有一些很小的白色菌落這些小的白色克隆為amp敏感的衛(wèi)星菌落,它們不包含質(zhì)粒。不要挑取這些很小的白色菌落。確認(rèn)amp的濃度,并且平板37℃培養(yǎng)的時(shí)間不要過長。挑菌時(shí)不要挑取這些小的白色菌落。白色菌落在液體培養(yǎng)基中不長 白色菌落為amp敏感的衛(wèi)星菌落確認(rèn)挑選大的白色菌落,確認(rèn)amp的有效性。

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