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RT-PCR實驗步驟

閱讀次數(shù):1453   發(fā)布時間:2012/9/19 8:33:45

 

一、組織抽提:
1.       取組織塊50-100㎎用液氮在研缽中研磨成粉末
2.       移入玻璃勻漿器加入1ml Trizol 抽打勻漿
3.       移入1.5ml新離心管用5 ml針頭抽打
4.       冰上孵育5分鐘
5.       離心12,000g 4 5分鐘取上清液移入1.5ml新離心管
6.       0.2 ml氯仿,震蕩,冰上孵育5分鐘
7.       離心<12,000g 4 10分鐘取上層液相移入1.5ml新離心管
8.       0.5 ml異丙醇,震蕩,冰上孵育5分鐘
9.       離心<12,000g 4 5分鐘棄去上清液
10.   加入1 ml 75%乙醇,震蕩
11.   離心<7,500g 4 5分鐘棄去上清液
12.   室溫下使之變透明
13.   加入DEPC處理水10μl --35μl 溶解RNA可保存在液氮或低溫冰箱)
14.   RNA變性電泳觀察18s,28s條帶,分光光度計檢測260/280吸光度比值,計算RNA濃度
 
 
 
 
二、RT反應體系(步):約20分鐘

RNA    抽提物
5μl
Radome引物
2μl
RNA sin
0.5μl

1.       65 15分鐘
2.       立即放入冰浴
RT反應體系(第二步):約2小時

RNA sin
0.5μl
10mM  dNTP
1μl
5×RT 緩沖液
4μl
25mM MgCl2
4μl
AMV 逆轉錄酶
3μl

1.       37 1.5小時
2.       94 5-10分鐘
3.       反應物保存于-20℃或進行PCR
1、PCR反應體系:約4.5小時

25mM MgCl2
2μl
10×PCR 緩沖液
5μl
10mM  dNTP
1μl
上下游引物10pmol/μl
2.5μl×2
CDNA模板
2.5μl
ddH2O
34μl
Taq
0.5μl
輕質石蠟油
50μl
 
100μl

1.       94 2分鐘,55 1分鐘,72 2分鐘為個步1個循環(huán)
2.       94 45秒,55 40秒,72 1分鐘為第二步30個循環(huán)
3.       72 10分鐘
4.       取出后4 5分鐘后-20℃保存或走電泳
2、PCR反應體系:約5小時

25mM MgCl2
3μl
10×PCR 緩沖液
5μl
10mM  dNTP
1μl
上下游引物10pmol/μl
2.5μl×2
CDNA模板
5μl
ddH2O
30μl
Taq
1μl
輕質石蠟油
50μl
 
100μl

1.       94 2分鐘,55 1分鐘,72 2分鐘為個步1個循環(huán)
2.       94 45秒,50 40秒,72 1分鐘為第二步40個循環(huán)
3.       72 10分鐘
4.       取出后4 5分鐘后-20℃保存或走電泳
四、電泳:約1.25小時
1.       0.5×TBE電泳緩沖液300 ml
2.       膠濃度1.7%40ml 0.5×TBE0.68g膠)
3.       微波爐中火2分鐘溶解膠
4.       冷卻至60℃加入溴乙錠2μl10mg/ml的終濃度0.5μg/ml
5.       放入梳子,澆板,待凝固
6.       8μl PCR反應產(chǎn)物+2μl溴酚蘭
7.       電泳50-80V每㎝ 5V

 

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